¿Qué software elegir si facturas para varios centros médicos en 2026?
En España la facturación a mutuas y aseguradoras la lleva el centro o quien la gestiona por él. El buen programa es el que te deja trabajar con varios centros sin pagar cada uno como si fuera una clínica nueva.
Llevas la administración de tres centros de fisioterapia, una consulta de psicología y una clínica dental. Cada uno factura a Adeslas, Sanitas y otras aseguradoras, con sus volantes, sus autorizaciones y sus liquidaciones. Y con Verifactu, que con las normas en vigor llega en 2027, cada factura tendrá que salir de un programa que lo cumpla. Los listados que salen en Google son programas estadounidenses traducidos que no hablan ni de mutuas ni de Verifactu.
La respuesta corta. Clinic Cloud tiene la mejor nota global y Verifactu desde el plan más barato, con un plan Enterprise para grupos de clínicas. Nubidoc es el más pensado para varios centros: multicentro sin coste en la misma cuenta y un módulo avanzado de mutuas. Nubimed no cobra los usuarios de recepción, administración y contabilidad. ObeliOmed incluye facturación y multicentro en su plan Enterprise.
Esta página es para quien factura por cuenta de varios centros. Si eres un profesional que factura su propia consulta, mira nuestro comparativa de software de facturación médica.
La clasificación es editorial: una plaza patrocinada siempre se indica en su ficha, y ningún enlace de afiliado cambia una nota.
El mejor programa según cómo facturas
4 programas comparados para quien factura varios centros
El puesto sigue la nota, calculada con los mismos cinco criterios que nuestra comparativa de software de facturación médica, leídos desde el puesto de quien gestiona varios centros. Las notas de cada programa son las mismas en las dos páginas. La columna de la derecha dice qué cambia para ti.
| Mejor para | Lo que cambia para ti | Plan gratis | Tamaño del equipo | Ver | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Clinic Cloud | El mejor en conjunto | Verifactu desde Mini, Enterprise para franquicias y grupos | 4.3/5 | 29 €/mes + IVA | — | Clínicas y grupos | Ver → |
| 2 | Nubidoc | Para varios centros en una cuenta | Multicentro sin coste, VeriFactu y TicketBAI incluidos | 4.2/5 | 44,90 € + 14,90 €/mes sin IVA | — | Gestores de varios centros | Ver → |
| 3 | Nubimed | Para equipos administrativos grandes | Usuarios de administración y contabilidad ilimitados y gratis | 4.0/5 | 50,10 €/mes sin IVA (PREMIUM) | — | Centros con equipo de recepción | Ver → |
| 4 | ObeliOmed | Todo incluido en Enterprise | Facturación y multicentro en el plan Enterprise | 3.9/5 | 29 €/mes por centro sin IVA + 15 € facturación | — | Grupos de centros | Ver → |
Precios sin IVA, leídos en la página oficial de cada editor en 2026.
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Cómo hemos comparado y puntuado
Esta página responde a una pregunta: ¿qué programa usar cuando facturas por cuenta de varios centros sanitarios? En España casi no existen empresas de facturación médica como en Estados Unidos. La facturación a aseguradoras y mutuas la lleva el personal de la clínica, una sociedad que gestiona varias clínicas o una gestoría. Su trabajo: emitir facturas legales, enviarlas a cada aseguradora con sus autorizaciones, cuadrar las liquidaciones y cumplir Verifactu (o TicketBAI en el País Vasco).
El criterio central, verificado en la página oficial de cada programa clasificado: ¿permite trabajar con varios centros, gestiona mutuas y aseguradoras, y cumple Verifactu? Después vienen el coste de los usuarios administrativos y el precio público. Un programa que no cita el trabajo con varios centros no entra en la clasificación.
Las notas usan los mismos cinco criterios y pesos que nuestra comparativa de software de facturación médica, para que un programa tenga la misma nota en todo el sitio. Mutuas y aseguradoras pesan un 30 %: es el trabajo diario de quien factura. La facturación legal pesa un 25 %, el precio real un 20 %, la agenda y la historia clínica un 15 % y la facilidad y el soporte un 10 %.
Hemos comparado las páginas oficiales de precios. No hemos encontrado opiniones de usuarios españoles fiables sobre este uso concreto, así que no citamos ninguna.
- Mutuas y aseguradorasMódulo de mutuas y aseguradoras, autorizaciones, liquidaciones, precio del módulo.30 %
- Facturación legalVerifactu y TicketBAI, series por centro, facturas rectificativas.25 %
- Precio realPrecio por centro, por usuario y por administrativo, permanencia.20 %
- Agenda e historia clínicaAgenda e historia clínica, que alimentan la facturación sin volver a teclear.15 %
- Facilidad y soportePuesta en marcha, soporte, migración de datos.10 %
Ningún enlace de afiliado cambia una nota o un puesto.
Los precios y los módulos de mutuas cambian cada año. Recibe las novedades de la clasificación
Clinic Cloud
Clinic Cloud tiene tres planes públicos: Mini a 29 €, Pro a 49 € y Max a 79 € al mes, más IVA, con 10 € por cada agenda extra. La facturación con Verifactu está incluida desde Mini, así que cualquier centro que gestiones cumple la norma sin pagar un módulo aparte.
Para quien factura varios centros, lo interesante es el plan Enterprise, pensado para franquicias y grupos de clínicas, con precio a convenir. Si gestionas tres clínicas de un mismo grupo, es la conversación que tienes que tener con el editor antes de dar de alta tres cuentas Max por separado.
El módulo de mutuas y aseguradoras existe, pero su precio no aparece en la página de tarifas. Pídelo por escrito, junto con el coste de cada agenda extra: en un centro con diez profesionales, las agendas suman más que el plan.
Su límite: el trabajo con varios centros solo se cotiza en Enterprise, sin precio público. Y el precio del módulo de mutuas no está publicado.
Consejo: antes de firmar Enterprise, pide una demo con dos centros reales y comprueba que puedes sacar un informe de facturación por aseguradora y por centro en la misma pantalla.
- Verifactu incluido desde el plan Mini
- Plan Enterprise para franquicias y grupos
- Sin permanencia
- ✓Precios públicos claros
- ✓Agenda e historia clínica completas
- ✓Mejor nota global de la comparativa
- ✗Precio del módulo de mutuas sin publicar
- ✗Enterprise a convenir
- ✗Cada agenda extra suma 10 €
El programa más completo para un grupo de clínicas que quiere cumplir Verifactu sin módulos extra. Si gestionas centros independientes entre sí, Nubidoc te sale más barato.
Nubidoc
Nubidoc es el programa que mejor encaja con quien factura para varios centros. Su multicentro no tiene coste: los centros se gestionan en la misma cuenta, sin pagar un plan por centro. Para una sociedad que lleva cuatro centros pequeños, eso cambia el presupuesto.
El plan base cuesta 44,90 € al mes sin IVA con un profesional, más 5,95 € por cada usuario adicional. El módulo de gestión avanzada de mutuas añade 14,90 € al mes. VeriFactu y TicketBAI están incluidos, algo útil si uno de tus centros está en el País Vasco. No hay permanencia y hay 15 días de prueba.
Haz la cuenta con tres centros y ocho usuarios: 44,90 € más siete usuarios a 5,95 €, más el módulo de mutuas, dan unos 101 € al mes sin IVA para todo. Con un programa que cobra por centro, la misma estructura cuesta varias veces más.
Su límite: cada usuario se paga, también los administrativos. Si tu equipo de recepción es grande, Nubimed sale mejor en ese punto.
Consejo: aprovecha los 15 días de prueba para cargar las tarifas de una aseguradora real en dos centros y comprobar que la liquidación sale separada por centro.
- Multicentro sin coste en la misma cuenta
- Módulo avanzado de mutuas a 14,90 € al mes
- VeriFactu y TicketBAI incluidos
- ✓Sin permanencia, 15 días de prueba
- ✓Ideal para varios centros pequeños
- ✓Precio total fácil de calcular
- ✗Cada usuario se paga, también administración
- ✗Módulo de mutuas aparte
- ✗Plan base más caro que la competencia
La mejor opción si gestionas varios centros independientes: los tienes en una sola cuenta sin pagar más por centro. Si tienes muchos administrativos, compara con Nubimed.
Nubimed
Nubimed tiene un punto que ningún otro programa de esta comparativa ofrece: los usuarios de recepción, administración, gestión y contabilidad son ilimitados y gratuitos. Para quien factura, eso significa que tu equipo entero entra en el programa sin aumentar la cuota.
Ojo con el plan. LITE cuesta 27,40 € al mes sin IVA, pero no incluye ni mutuas ni Verifactu: no sirve para facturar a aseguradoras. El plan que necesitas es PREMIUM, a 50,10 € al mes sin IVA, con facturación TicketBAI y Verifactu y gestión de mutuas. Cada agenda adicional suma 5,10 € en PREMIUM. No hay cuota de entrada ni permanencia.
Existe un plan MULTICENTRO, pero su precio no está publicado. Si gestionas varios centros, es la primera pregunta que tienes que hacer.
Su límite: el multicentro se cotiza aparte y sin precio público, y el plan barato no sirve para facturar mutuas.
Consejo: los SMS a pacientes cuestan 0,08 € cada uno. Si tus centros envían recordatorios de cita, súmalos al presupuesto mensual.
- Administrativos y contabilidad ilimitados y gratis
- Mutuas y Verifactu en PREMIUM
- Sin cuota de entrada ni permanencia
- ✓Equipo administrativo sin coste extra
- ✓Agendas adicionales baratas
- ✓TicketBAI incluido en PREMIUM
- ✗LITE no incluye mutuas ni Verifactu
- ✗MULTICENTRO sin precio publicado
- ✗SMS a 0,08 € cada uno
El mejor programa si tu equipo administrativo es grande: nadie de recepción ni de contabilidad paga licencia. Pide el precio de MULTICENTRO antes de llevar varios centros.
ObeliOmed
ObeliOmed cobra por centro: LITE 29 €, PLUS 49 € y ENTERPRISE 79 € al mes sin IVA. La facturación está incluida en ENTERPRISE y cuesta 15 € al mes en los demás planes. El multicentro solo existe en ENTERPRISE, por 20 € más al mes.
Cada usuario administrativo suma 10 € al mes, y cada especialista 25 €. Si pagas un año por adelantado, pagas 10 cuotas en lugar de 12. No hay permanencia ni coste de alta.
Para quien factura varios centros, la cuenta sube rápido: tres centros en ENTERPRISE más el multicentro dan unos 257 € al mes antes de usuarios. Es más caro que Nubidoc, pero lo tienes todo en un plan.
Su límite: el precio por centro penaliza a quien gestiona muchos centros pequeños. La página de precios no cita Verifactu ni aseguradoras: lo hace la página de facturación médica del editor, que conviene leer antes.
Consejo: pide al editor que confirme por escrito que el plan ENTERPRISE incluye Verifactu y la facturación a aseguradoras en todos los centros.
- Facturación y multicentro en ENTERPRISE
- 12 meses por el precio de 10
- Sin permanencia ni coste de alta
- ✓Todo en un solo plan
- ✓Administrativos a 10 € al mes
- ✓Descuento anual claro
- ✗Precio por centro
- ✗Multicentro solo en ENTERPRISE, +20 € al mes
- ✗Verifactu no citado en la página de precios
Un buen plan único para un grupo que quiere todo incluido y paga al año. Para muchos centros pequeños, el precio por centro pesa demasiado.
Tres maneras de facturar por cuenta de varios centros, tres necesidades distintas
Antes de elegir programa, aclara desde qué puesto facturas. Cambia lo que necesitas pagar.
La sociedad que gestiona varias clínicas
Facturas para centros del mismo grupo o franquicia. Necesitas ver todos los centros en una sola cuenta y sacar informes por aseguradora y por centro. Nubidoc, con multicentro sin coste, y los planes Enterprise de Clinic Cloud y ObeliOmed son los más adecuados.
La gestoría que lleva centros independientes
Cada centro es un cliente distinto, con su propio NIF y su propia serie de facturas. Lo más sencillo suele ser trabajar en el programa de cada centro, con un usuario administrativo a tu nombre. Ahí Nubimed, que no cobra los administrativos, te deja entrar sin coste para el cliente.
El equipo administrativo de una clínica grande
Recepción, facturación y contabilidad dentro de la clínica. El coste de los usuarios administrativos pesa más que el multicentro. Compara el precio total con todo tu equipo dado de alta.
- ¿Cuánto cuesta añadir un centro más, el día que lo das de alta?
- ¿Los usuarios administrativos se pagan o son gratis?
- ¿El módulo de mutuas está incluido o se paga aparte?
- ¿Verifactu está incluido en el plan que vas a contratar?
- ¿Puedes sacar la facturación por aseguradora y por centro?
- ¿Hay permanencia, y qué pasa con los datos si te vas?
Otro programa a conocer
Este programa aparece en la búsqueda y tiene buen precio, pero su página no cita el trabajo con varios centros, nuestro criterio central.
NexusClinic: barato para un centro, sin multicentro citado
Un centroNexusClinic tiene tres planes: Autónomo a 19 €, Clínica a 29 € y Centro a 49 € al mes sin IVA, con un 17 % de descuento en pago anual. VeriFactu está integrado o se conecta a una facturación externa. Su página no cita la facturación a mutuas ni a aseguradoras. Está pensado para fisioterapia, podología, psicología y estética. No lo clasificamos aquí porque su página no menciona la gestión de varios centros: es una buena opción para el centro que factura solo, menos para quien gestiona varios.
- Precio
- Desde 19 €/mes sin IVA
- Para quién
- Un centro de fisioterapia o psicología
El coste real para tres centros y ocho usuarios
Las páginas de precios muestran un centro. Tu factura es la suma de todos. Estas cuentas usan los precios públicos sin IVA.
Nubidoc: una cuenta para los tres
MulticentroPlan base de 44,90 € con un usuario, siete usuarios más a 5,95 € y el módulo de mutuas a 14,90 €: unos 101 € al mes sin IVA para los tres centros, sin coste de multicentro.
- Total
- Unos 101 €/mes sin IVA
ObeliOmed: un plan por centro
Por centroTres centros en ENTERPRISE a 79 € más 20 € al mes de multicentro dan unos 257 € al mes sin IVA, antes de sumar usuarios administrativos a 10 € y especialistas a 25 €. Con el pago anual, 12 meses cuestan como 10.
- Total
- Unos 257 €/mes sin IVA, sin usuarios
Nubimed: el equipo administrativo gratis
AdministrativosEn PREMIUM, a 50,10 € al mes, los usuarios de administración y contabilidad no cuentan. El precio de MULTICENTRO no está publicado: pídelo antes de comparar con Nubidoc.
- Desde
- 50,10 €/mes sin IVA
Lo que hace perder dinero a quien factura para varios centros
Ninguna de estas trampas aparece en una página de precios.
Contratar el plan barato sin mutuas
PlanEl plan LITE de Nubimed no incluye ni mutuas ni Verifactu. Si facturas a aseguradoras, necesitas PREMIUM. Lee siempre qué plan incluye el módulo de mutuas antes de comparar precios.
- Revisa
- Mutuas y Verifactu en el plan
Olvidar Verifactu en alguno de los centros
LeyCada centro emite sus facturas, y cada factura tendrá que cumplir Verifactu, o TicketBAI en el País Vasco. Si gestionas un centro con un programa antiguo, ese centro quedará fuera de la norma aunque los demás cumplan. Revisa centro por centro.
- Revisa
- Verifactu en cada centro
Pagar licencia por cada administrativo
PrecioEn la mayoría de programas, cada usuario suma a la cuota. Con un equipo de cinco administrativos, la diferencia entre Nubimed (gratis) y un programa que cobra 10 € por usuario es de 50 € al mes por centro.
- Calcula
- El precio con todo tu equipo
No contar las agendas extra
PrecioClinic Cloud cobra 10 € por agenda extra y Nubimed 5,10 € en PREMIUM. Un centro con muchos profesionales paga más en agendas que en el plan. Pide el precio con todos los profesionales dados de alta.
- Calcula
- El precio con todas las agendas
¿Facturas para centros sanitarios? Recibe nuestra próxima comparativa
Para ir más lejos
Estas páginas completan esta, desde el lado de la consulta y de la factura legal.
Clasificado para un solo centro.
Tus centros necesitan agenda e historia clínicaSoftware de gestión de consulta médicaLa consulta completa.
Solo te preocupa cumplir VerifactuProgramas de facturación VerifactuFacturación legal para cualquier negocio.
Tus preguntas sobre la facturación de varios centros
¿Qué programa permite gestionar varios centros médicos?
Nubidoc incluye el multicentro sin coste en la misma cuenta. ObeliOmed lo ofrece en ENTERPRISE por 20 € más al mes, y Nubimed y Clinic Cloud lo cotizan aparte en planes sin precio público. Pide siempre el informe por centro en la demo.
¿Cuánto cuesta un software de facturación médica para varios centros?
Con tres centros y ocho usuarios, desde unos 101 € al mes sin IVA en Nubidoc hasta unos 257 € en ObeliOmed ENTERPRISE antes de usuarios. La diferencia viene de cobrar por cuenta o por centro.
¿Es obligatorio Verifactu para las clínicas?
Verifactu es el sistema de facturación verificable de la Agencia Tributaria, obligatorio para sociedades y autónomos en 2027 según las normas en vigor (Hacienda ha anunciado un nuevo aplazamiento que aún no está en el BOE), con TicketBAI en el País Vasco. La obligación depende de la situación fiscal de cada clínica: consúltalo con tu asesor y comprueba que tu programa lo incluye.
¿Cómo se factura a las mutuas y aseguradoras?
El centro factura a cada aseguradora según sus tarifas y autorizaciones, y después cuadra la liquidación. Un módulo de mutuas guarda las tarifas de cada aseguradora y te avisa de lo pendiente. En Nubidoc cuesta 14,90 € al mes; en Nubimed va incluido en PREMIUM.
¿Los usuarios administrativos se pagan?
Depende del programa. Nubimed los da gratis e ilimitados, ObeliOmed los cobra a 10 € al mes y Nubidoc a 5,95 € por usuario. Con un equipo grande, es el criterio que más cambia el precio.
¿Puedo externalizar la facturación de mi clínica?
Sí, a una gestoría o a una sociedad que gestione varios centros. Lo más práctico es darle un usuario administrativo en tu programa, en lugar de pasar facturas en papel. Así conservas tus datos si cambias de proveedor.
